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不过，在IP网统治整个网络世界的过程中，仍旧出现了一些不和谐的因素——在SAN（存储区域网）领域，基于IP协议的iSCSI标准遭到了FC（光纤通道）标准的强劲阻击。尽管有IBM、思科、英特尔等巨头的大力推动，但在iSCSI标准制定将近2年以后，iSCSI标准在存储领域仍旧未能成为主流，其市场总值远远小于FC，甚至目前还未能进入正常的商业轨道。根据IDC的统计，在2003年，iSCIS的全球收入仅为1800万美元，而SAN市场接近100亿美元。
按照博科公司中国区技术总监司马聪博士的说法：“iSCSI标准是在夹缝中生存，其生存空间相当狭小。”他做出这种判断的依据是，在传统的块（block）级数据传输中，FC的性能优势堵死了iSCSI标准进军高端领域的通道，而NAS产品在文件（File）传输服务上的优势，再次打压了iSCSI在低端市场上的生存空间。因此，iSCSI标准的腾挪余地不大，生存艰难。需要指出的是，博科公司在FC交换机市场上占据了一半以上的市场份额。
不过，Adaptec公司中国区首席代表吴刚先生并不这么认为。他说，iSCSI标准支持以太网所带来的灵活性、低价格等优势，使iSCSI产品在中小企业市场上能够获得极大的成功。iSCSI产品目前所需要抢夺的并不是FC SAN已有的市场，而是新开发出来的中小企业外部存储市场。与博科公司相反，Adaptec公司在外部存储产品中主推iSCSI产品。
定位转向中小企业
Adaptec、微软、惠普、IBM等公司都认为，iSCSI产品目前最合适的定位就是中小企业的小型SAN。IBM中国公司存储产品经理庞文峥认为，对那些基于数据库应用，但是又不想采用昂贵IP SAN技术的用户来说，iSCSI技术可以很好地利用现有IT基础架构，这部分的中低端市场是最近一两年iSCSI能有所作为的空间。Adaptec公司认为，目前在存储市场中，围绕光纤通道已经有各种各样的解决方案和服务，而且光纤通道已成为许多与之相关的厂商的核心。但对于那些无力购买光纤通道SAN的工作组和小型商家，iSCSI将成为市场扩展的手段。惠普亚太区网络存储解决方案产品经理李青桥则表示，IP SAN的目标市场是中小企业市场和企业远程分支机构，特别是在中低端服务器为主的环境中，而数据中心仍会是FC SAN，但IP会将SAN扩展到数据中心之外。
而在微软看来，iSCSI目前的定位就是取代DAS（直连存储）市场。微软亚洲区业务拓展经理邱伯毓表示：“传统上的基于SCSI硬盘的DAS方式所提供的存储服务有诸多限制，最关键的是三点：首先是与服务器连接距离有限，不到十米，无法提供异地容灾的环境；其次是可连接的服务器数量有限，一般只有两台，无法服务更大规模和更复杂的应用环境；第三是SCSI盘阵受固化的控制器限制，无法进行在线扩容，也更谈不上动态部署。iSCSI技术所取得的突破，在这三方面是革命性的：建立在IP网络上，连接距离可以无限，连接的服务器数量无限，由于是服务器架构，也可以实现在线扩容以至动态部署。”
但实际上，iSCSI技术最初的设计目标就是代替FC技术，但经过数年来的发展，基于iSCSI标准的主流产品在性能上与FC产品仍旧有差距，无法满足高端市场的需求，这也导致了iSCSI产品在2003年～2004年中期这段时间的相对沉寂。吴刚说：“一些大公司在iSCSI产品上的断档确实对整个iSCSI市场的迅速推广产生了不好的影响。缺乏大的存储厂商的支持，用户对iSCSI产品的接受度就不那么高。另外，尽管市场上已经推出了性能非常好的iSCSI存储交换机产品，遗憾的是该供应商的号召力不够，无法将产品大规模推广。相反，主流iSCSI存储交换机供应商的产品在性能上还不够理想，这也限制了iSCSI标准的快速推广。”
司马博士则完全从技术角度出发解释了iSCSI的定位变化：“由于IP网的设计理念和实现手段与SAN所需要的并不一致，基于iSCSI的产品很难满足存储对数据传送、保存的要求，这个客观事实决定了iSCSI无法与FC直接竞争。iSCSI的作用就是把那些对性能与可用性要求不高的服务器等设备连接到SAN上来。 ”
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